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101 secrets de l'ADN

Table des matières

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Couverture 1
Présentation de l’éditeur 2
Titre 5
Sommaire 6
Introduction 9
L’ADN revèle les secrets du vivant 10
Pourquoi l’ADN ? 10
Interroger l’ADN 18
Pourquoi 101 secrets de l’ADN ? 22
Embarquement immédiat ! 26
1. Exploration haut débit du vivant 29
1. Explorer et représenter la totalité de l’arbre du vivant 30
2. À la recherchede LUCA, notre ancetre commun 33
3. L’ADN, support universel de l’information génétique 35
4. L’ARN : un couteau suisse indispensable à la vie 38
5. L’émergence des euraryotes : une mosaique d’ADN 41
6. De nouvelles archées redessinent l’arbre du vivant 44
7. À la recherche de la matière noire du monde vivant 47
8. Big Bang chez les virus 50
9. Le séquençage ADN s’envole vers le très haut débit 53
10. Comparer les généomes révèle les singularités des organismes 55
11. Éloge du désordre dans le génome des cyanobactéries du genre Microcystis 58
12. Comparer les ARN informe sur le comportement des organismes 61
13. La duplication des génomes analysée par leur transcriptome 64
2. Inventaire et connaissance de la biodiversité 67
14. Les transferts de gènes : des traces génétiques du passé 68
15. Sélectionner des portions de génomes pour reconstruire les histoires évolutives des espèces 71
16. Qu’est-ce qu’une espèce bactérienne ? 74
17. Délimiter les espèces à partir de leurs génomes 77
18. Reconstitution biogéographique des espèces par l’ADN maternel 79
19. Des codes-barres ADN pour chacun et pour tous 82
20. Des OTUs pour caractériser la diversité microbienne 86
21. Les grandes expéditions océanographiques du XXI siècle 89
22. Crise du stockage : conserver les molécules d’ADN ou les données informatiques de l’ADN ? 92
23. Un inverntaire de la diversité microbienne de la Terre 94
24. Biodiversification dess communautés microbiennes 97
25. Big Data et traitements informatiques des séquences ADN 99
26. Big Data et détection des erreurs des données moléculaires 102
27. Écogénomique des virus 105
28. Des branches méconnues du vivant des océans 108
29. Role des espèces rares dans les écosystèmes 111
3. L’ADN, témoin moléculaire de l’évolition des organismes 115
30. L’évolution des espèces décryptée par la lecture des chromosomes 116
31. Les petites populations font des gros génomes 119
32. Couts et bénéfices des éléments transposables dans les génomes 122
33. Incompatibilité hybride et séquences répétées 125
34. Comprendre la formation des espèces 128
35. Faire du sexe ou pas, telle est la question ! 131
36. Anchois cotiers, anchois du large : des échanges génétiques ? 134
37. Les biais de codon dans les génomes 137
38. L’évolution en direct : la génomique de l’adaptation 140
39. Les bactéries intracellulaires des champignons 143
4. Vivre sous contraintes 147
40. Les méta-omiques pour étudier l’adaptation à la vie marine 148
41. Vivre sous pression dans la biosphère profonde 151
42. Symbioses dans les abysses 154
43. Face à de multiples contraintes : choisir pour survivre 157
44. Le manchot Empereur : une population fragile face au changement climatique ? 159
45. Les bactéries magétotactiques fabriquent des minéraux 162
46. Un poison délicieux : des espèces frugivores s’accommodent de plantes toxiques 165
47. Adaptation locale des plantes à un environnement changeant 167
48. Fable génomique : quand les mésanges arrivent en ville 170
49. Tolérance et hyperaccumulation des métaux chez les plantes 173
50. Une vie microbienne intense dans les eaux souterraines 176
51. D’où viennent les bactéries pathogènes des plantes ? 179
52. Role des petits ARNs dans la régulation de l’expression des génomes 182
53 Transmettre une réponse adaptative sans changer ses gènes : l’épigénétique 185
5. Interactions entre espèces 189
54. Et la lumière fut… Comment la sépiole recrute des symbiotes luminescents 190
55. Antibiose et antibiorésistance tuer et ne pas etre tué 192
56. Des virus responsables d’échanges de gènes entre un hote et son parasite 194
57. La symbiose fixatrice d’azote : analyse de haute précision 197
58. Comment un pathogène bactérien change d’hote 200
59. Adaptation sensorielle et changement d’hote 203
60. Se ressembler pour se protéger : le mimétisme 205
61. Exploration du microbiote digestif du rumen 208
62. Des bactéries changent le sexe de leur hote 210
63. Deux symbiotes valent quelquefois mieux qu’un ! 212
64. Réduction des génomes : de l’endosymbiose en série 215
6. Fonctionnement et fragilité des écosystèmes 219
65. Les communautés microbiennes d’eau douce résistent à la sécheresse saisonnière 220
66. Connaitre le régime alimentaire par le code-barres ADN des excréments 223
67. Comprendre la symbiose en combinant les omiques 226
68. Modéliser le vivant en agrégeant les omiques 229
69. Production métabolique d’une algue rouge, une « arme » pour la prolifération ? 232
70. La pollinisation : un sevice des écosystèmes majeur pour l'humanité 235
71. Le plancton : un acteur de la régulation planétaire du CO2 238
72. Les communautés fongiques contribuent au cycle du carbone 241
73. Importance de la biodiversité des sols pour le cycle de l’azote 244
74. L’étude des séquences d’ADN à partirde cellules individuelles contribue à dévoilerl’écologie de bactéries de l’océan profond 246
75. Les mouvements de la houle modifient les communautés microbiennes des sédiments 249
76. Vers une écologie des systèmes pour modéliserles communautés microbiennes 252
77. La capture de gènes : une exploration ciblée de l’ADN des communautés microbiennes 255
7. Paléogénomique et histoires évolutives 259
78. Le séquençage à haut débitouvre les archives fossiles de l’ADN ancien 260
79. Lire les archives ADN des sédiments pour connaître les paysages et pratiques du passé 263
80. Changements climatiques : 150 000 ansd’évolution des populations de bisonsen Europe 266
81. Histoire génétique du peuplement de l’Europe par l’Homme moderne 269
82. Origine et histoire évolutivedes chiens européens 272
83. Analyser les archives sédimentaires pour comprendre les variations de la biodiversité face à la pollution et au réchauffement climatique 275
84. De la génomique à la muséomique :les collections à l’honneur 278
85. Métagénomique de communautés microbiennesbâtisseuses de roche : comprendre le présentpour expliquer le passé 280
86. De la vie à plusieurs kilomètres dans les sédiments marins 283
87. Longue histoire commune entre des virus et des humains 286
88. Des croisements entre variétés ont contribué à l’expansion géographique mondiale d’une espèce cultivée, le maïs 289
8. L’humanité et son environnement 293
89. Perception de la biodiversité :les robes des chevaux 294
90. L’Homme microbien et la médecine de demain 297
91. Modifier l’ADN : l’outil moléculaire CRISPR-Cas9 299
92. Échange de gènes entre champignons du fromage 301
93. Les nanoparticules modifient le microbiotedes plantes 304
94. L’environnement : un réservoir de gènesde résistance aux antibiotiques 306
95. Le 7e continent : un néo-écosystème qui transforme la biodiversité des océans 309
96. Détecter l’effet des toxines environnementales 312
97. Pollutions minières : un impact environnemental à long terme 315
98. Usage des sols en Europe :quel impact sur leur biodiversité ? 318
99. Des bactéries pathogènes opportunistes en ville 320
100. Bioréacteurs microbiens de méthanisationdes déchets organiques 322
101. La diversité génétique passée comme outil en conservation 325
Index 329
Table des matières, auteurs, bibliographies 333
Légendes et crédits des photos d’ouverture de chapitre 357
Remerciements 359
Retrouvez tous les ouvrages de CNRS Éditions sur notre site www.cnrseditions.fr 360

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